Деятельностью Думы руководили Председатель и два его Товарища, выбираемые на год. Товарищи вели заседания в отсутствие Председателя.
Председателями Думы избирались: Н. А. Хомяков (с 01 ноября 1907 года, отказался от поста 06 марта 1910 года), А. И. Гучков (с 10 марта 1910 года, отказался от поста 20 июня 1910 года, 29 октября 1910 года выбран вторично, отказался от поста 15 марта 1911 года), М. В. Родзянко (с 22 марта 1911 года до закрытия Думы, впоследствии был Председателем Думы IV созыва).
Товарищами Председателя Думы избирались: барон А. Ф. Мейендорф (с 05 октября 1907 года, отказался от поста 01 февраля 1908, вторично избран 08 февраля 1908 года, не переизбран 30 октября 1909 года), князьВ.М.Волконский (c 05 октября 1907 года до закрытия Думы), С. И. Шидловский (с 30 октября 1909 года, не переизбран 29 октября 1910 года), М.Я.Капустин (с 29 октября 1910 года до закрытия Думы). Из всех этих лиц кн. В. М. Волконский принадлежал к фракции умеренно правых, а все остальные были октябристами.
Секретарем Думы на все время ее работы был избран И. П. Созонович (правый).
Председатель Думы, его Товарищи, Секретарь Думы и его старший Товарищ образовывали Совещание Думы, полномочия которого были ограничены хозяйственными вопросами и управлением персоналом Думы.