Функции и последствия повреждения миндалевидного тела изучены в основном в опытах на животных.
Этот отдел, называемый также миндалиной или амигдалой, обеспечивает хранение информации о значимости условных раздражителей (например, о том, что вид открывающейся клетки и входящего служителя зоопарка означает подачу корма).Для этого миндалевидное тело образует обширные связи с корой больших полушарий, в частности с теменно-височно-затылочной ассоциативной зоной (анатомически миндалевидное тело непосредственно примыкает к височной доле); при этом в миндалевидное тело поступает информация не от первичных, а от вторичных и ассоциативных зон (в естественной среде условным раздражителем бывает не одиночная точка сетчатки, а цельный зрительный образ, например вид яблока; не отдельный звук, а характерное сочетание звуков, например команда «сидеть!» для собаки и пр.).