1. По своей сущности, проблемы делятся на эмпирические,
связанные с разрешением противоречия между фактами и их истолкованием и теоретические, возникающие из противоречий внутри теории и предполагающие их разрешение.
2. В зависимости от роли в познавательном процессе проблемы подразделяются на главные и производные. Проблема: «В чем сущность пространства и времени?» - главная, но она распадается на ряд производных: «Что такое пространство?»; «Что такое время?»; «Как они связаны между собой?»; «Каким образом пространство и время связаны с движением материи?»
3. С точки зрения структуры проблемы делятся на простые, содержащие один вопрос, хотя ответ далеко не прост и сложные, состоящие из нескольких связанных вопросов.
4. Иногда выделяются реальные и мнимые проблемы.