Для проведення досліджень використовували сухі поживні середовища
фірми "Меrck" та фірми "Scharlau", які є валідовані та не відрізняються за ростовими і селективними властивостями щодо тих мікроорганізмів, для виділення яких вони призначені. Приготування середовищ проводили згідно з інструкції виробника.
1. Колумбія агар (основа) з додаванням 100 мг/л канаміцину, 7,5 мг/мл ванкоміцину, 1,5 мг/л вітаміну К3 (менадіон), 5% еритроцитів барана для культивування грамнегативних неспороутворюючих облігатно-анаеробних бактерій, а саме бактерій родів Bacteroides, Prevotellа.
2. Колумбія агар (основа), в яке у якості селективних компонентів вносили 3,2 мг/л кристалічного фіолетового, 5 мг/л еритроміцину та 5% еритроцитів барана, призначене для виділення бактерій роду Fusobacterium.
3. Тіогліколеве середовище з резазурином – нагромаджувальне поживне середовище для анаеробних мікроорганізмів.
4. Соєво-казеїновий бульйон з агаром та азидом натрію у концентрації 100 мг/л для виділення бактерій роду Bifidobacterium.
5. Cередовище МРС для виділення бактерій роду Lactobacillus. З метою уникнення росту дріжджеподібних грибів роду Candida у середовище додавали сорбінову кислоту. Для цього готували розчин сорбінової кислоти в 1М NaOH із розрахунку 14 г/л і стерилізували фільтруванням. До 900 мл приготованого середовища МРС вносили 100 мл приготованого розчину сорбінової кислоти.
6. Колумбія агар (основа) з додаванням крові барана (5%), вітаміну К, налідиксової кислоти (10 мг/л) і колістину (10 мг/л). Призначене для виділення бактерій роду Eubacterium та грампозитивних анаеробні коків Peptococcus, Peptostreptococcus.
7. Для виділення бактерій роду Clostridium використовували агаризоване середовище RCM та метиленову синьку у співвідношенні 1:20000 для запобігання насичення киснем.
8. Агар МакКонкі – селективне середовище для виділення бактерій родини Enterobacteriaceae.
9. Ентерокок агар – хромогенний агар для ідентифікації бактерій роду Enterococcus.
10. Агар Байрд-Паркера – середовище для виділення бактерій роду Staphylococcus.
11. Цетримідний агар – середовище для виділення бактерій Pseudomonas aeruginosa.
12. Salmonella Shigella агар для виявлення бактерій родів Salmonella, Shigella, Proteus.