Органами управління служби пального є:
- відділ постачання пального Департаменту постачання матеріальних ресурсів МОУ;
- Центральне управління забезпечення пально-мастильними матеріалами Головного управління логістики Командування сил підтримки ЗСУ (ЦУЗПММ);
- у видах ЗСУ -служба пального та мастильних матеріалів управління тилового забезпечення логістики Командування СВ ЗСУ;
- служба пально-мастильних матеріалів та ракетного палива логістики Командування ПС ЗСУ; служба пального та мастильних матеріалів управління тилового забезпечення логістики Командування ВМС ЗСУ;
- в армійському корпусі, повітряному командуванні, військово-морській базі – служба пально-мастильних матеріалів відділу логістики, армійського корпусу, повітряного командування, військово-морської бази;
- у з’єднанні, береговій базі з’єднання кораблів, військовій частині - начальник
служби пально-мастильних матеріалів.
- у військовій частині, де посаду начальника служби пального штатом не передбачено, виконання його обов’язків покладається наказом командира військової частини на одну з посадових осіб цієї військової частини.
- у з’єднанні кораблів, які не мають берегової бази, обов’язки начальника служби
пального виконує начальник служби пального морського району, а на кораблі – командир електромеханічної бойової частини корабля (командир БЧ-5).
До військових частин, підрозділів та установ служби пального відносяться:
- окремий трубопровідний батальйон;
- центри забезпечення пальним (далі - ЦЗП); бази, склади пального і ракетного палива;
- військові склади пального;
- військові представництва МОУ на підприємствах національної економіки;
- лабораторії контролю якості пального та хіммотологічний центр МОУ.
ЦУЗПММ є центральною службою забезпечення, на яку покладено функції забезпечення військ, сил пальним і технічними засобами за визначеною номенклатурою відповідно до Тимчасового переліку служб, які здійснюють забезпечення військовим майном, затвердженого наказом Міністра оборони України від 10 грудня 2005 року № 734.
ЦУЗПММ виконує покладені на нього завдання у взаємодії з відповідними службами видів ЗС України.