Отже, стан відображає рівень функціонування як окремих систем, так і всього організму. Тому цілком логічно говорити не про психічних, або психофізіологічних, станах, а про функціональні стани. Що ж такий функціональний стан і який сенс вкладається в слова «функціональне» і «функціонування»?
Під рівнем функціонування складної фізіологічної системи, що володіє властивістю самоконтролю, саморегуляції і самоврядування, розуміють відносно стабільну величину специфічної реакції, обумовлену природою подразника і властивостями системи. П. К. Анохин вважає, що центральною ланкою будь-якої системи є результат її функціонування — її систе-мообразующий чинник. Таким системообразующим чинником для цілісного організму є адаптація. Отже, функціональний стан є характеристика рівня функціонування систем організму в певний період часу, що відображає особливості гомеостазу і процесу адаптації. Досягнення того або іншого рівня функціонування здійснюється завдяки діяльності механізмів регуляції. Що є механізмами регуляції організму?
З позиції кібернетичної науки живий організм розглядається як багаторівнева, саморегульована і така, що саморозвивається система. Причому існує декілька точок зору на структуру біосистеми. На нашу думку, найбільш перспективним є припущення про існування механізмів управління і керованих систем. До механізмів, що управляють, в такій моделі слід віднести центральну і вегетативну нервову систему, а решта всіх систем організму є керованими.
В даний час відомі численні спроби пояснити принципи діяльності механізмів управління і класифікувати функціональні стани. Згідно сучасним уявленням, ключовою ланкою в структурі загального функціонального стану організму є стан центральної нервової системи. При цьому стан нервової системи розглядається як результат взаємодії неспецифічної активності, що генералізує, джерелом якої є ретикулярна формація, і специфічної активності, що має ряд локальних джерел. Останні визначають рівень уваги і сприйняття, понятійного мислення, моторної активності, мотивації і емоцій. Під специфічною активністю розуміється властива конкретній системі організму реакція на певний зовнішній або внутрішній стимул.
Особливе положення нервової системи як що управляє і забезпечує цілісність всього організму визначається її властивостями і особливостями, і в першу чергу структурною цілісністю мозку. Ця цілісність виявляється перш за все в здатності мозкових структур при необхідності брати на себе функції пошкоджених відділів. Іншою важливою особливістю центральної нервової системи є наявність жорстко фіксованих і щодо незалежних від середовища програм, обслуговуючих біоритми. Наступна властивість центральної нервової системи — її домінантна природа, що визначає таку функцію мозку, як регуляція станів організму і поведінки. Наявність даних властивостей і дозволяє розглядати нервову систему як фізіологічну основу механізмів регуляції.