Автоматизовані бухгалтерсько-фінансові системи управління холдингом дозволяють виділити основні центри фінансового управління, поставити під контроль витрати фірми, її внутрішні і зовнішні фінансові потоки. Конфігурація автоматизованої фінансової системи будується в залежності від особливостей структурної схеми холдингу. Технологія комп'ютеризації бюджетно-фінансового механізму компанії ґрунтується на введенні кодифікатора і додаткових аналітичних ознак бухгалтерських проводок. У результаті дані і звітність виробляються не тільки для визначених видів продукції, але й у різних структурних підрозділах.
Фінансові потоки і доходи перерозподіляються між центрами фінансового управління за допомогою спеціальних коефіцієнтів (схему розподілу ресурсів формує керівництво компанії). Таким шляхом реалізується та чи інша модель розподілу ресурсів і формування бюджетів структурних підрозділів і дочірніх фірм компанії. Бюджетна система вилучених філій і дочірніх фірм також може бути інтегрована в загальний комп'ютеризований комплекс.
У залежності від обраної моделі господарські операції філії або автоматично «переносяться» на бухгалтерські рахунки центральної компанії, або баланси філії формуються відносно незалежно з наступною інтеграцією в «центральний» баланс компанії. Для цього використовуються сучасні засоби передачі даних, включаючи супутниковий зв'язок, «виділені» канали зв'язку і спеціалізовані телекомунікаційні системи. Комп'ютерна система моделює напрямки бюджетної політики підприємства.
Автоматизована система управління фінансами холдингу вирішує дві основні задачі. На рівні центрів прибутку вона формує поточні дані про рух грошових засобів і техніко-економічних параметрів виробництва (структури виробничих витрат). Ця інформація дозволяє менеджерам швидко реагувати на відхилення від планових показників за доходами і витратами. Таким чином, досягається надійний контроль за рівнем ліквідності, що дозволяє більш надійно прогнозувати фінансовий стан. На вищому рівні управління фінансова служба забезпечує керівництво даними для оперативного управління і довгострокового планування операцій холдингу.