Рожь относится к семейству Роасеае, трибе Triticeae, роду Secale L.
До настоящего времени у ботаников нет единого мнения относительно видового состава, филогенетических связей и происхождения ржи. В 18 систематиках рода Secale L. описано от трех до 14 видов. Первая систематика была создана в 1923 г. советским ботаником А. А. Гроссгеймом: весь род ржи он делил на три политипических вида. Наиболее близка к этой классификации систематика, предложенная В. Д. Кобылянским, который на основании многолетнего изучения и критического анализа комплекса характеристик (морфологии, анатомии, эмбриологии, кариологии, цитогенетики, репродуктивной совместимости, обособленности ареалов и др.) выделил в роде Secale L. четыре вида, объединенных в две секции: 1 — sect. Oplis- menolepis Nevski (плотнозакрыточешуйчатая), включающая дикорастущие однолетние и многолетние виды; II — sect. Secale, включающая вид рожь посевная, разделенный на пять подвидов.
Ботаническая система рода (по В. Д. Кобылянскому)
I.Sect. Oplismenolepis II. Sect. Secale
1. S. silvestre Host 4. S. cereale L
2. S. iranicurn Kobyl. subsp. cereale
3. S. montanum Guss. subsp. vavilovii (Grossh)
subsp. montanum Kobyl
subsp. kuprijanovii subsp. tetraploidum Kobyl.
(Grossh.) Tzvel. subsp. derzhavinii (Tzvel.)
subsp. anatolicum (Boiss.) subsp. tsitsinii Kobyl.
Tzvel.
subsp. africanum (Stapf) Kranz
Вид S. cereale L. (рожь посевная) полиморфный, объединяет все формы диплоидной и тетраплоидной культурной однолетней и многолетней, а также сорно-полевой ржи с неломким и ломким колосовым стержнем.
Все дикорастущие виду sect. Oplismenolepis диплоидные (2п=14), имеют ломкий колосовой стержень, распадающийся после созревания, мелкое светло-коричневое зерно (масса 1000 зерен 5—17 г).
Установлено два генетических центра максимального разнообразия форм ржи. Первичный генцентр, являющийся и родиной культурной ржи, расположен на территории Малой Азии, Закавказья, Северо-Западного Ирана (Переднеазиатский ген- центр). Здесь произрастают и все дикие виды ржи. Второй генцентр со значительно меньшим разнообразием S. cereale и одним диким видом — S. silvestre включает Северо-Восточный Иран, Афганистан, в нашей стране — Среднюю Азию (Среднеазиатский генцентр). Этот центр считается вторичным, образовавшимся в результате миграции форм ржи из первичного ген- центра.
Н. И. Вавилов установил, что культурная рожь произошла из Сорно-полевой, которая как засоритель продвигалась с посевами пшеницы и ячменя в более северные и высокогорные районы, где она оказалась более холодостойкой и постепенно, вытесняя пшеницу и ячмень, стала основной культурой.
Благодаря широкому расселению ржи посевной, развитию селекционных работ в течение последнего столетия создано много сортов и форм этой культуры, возделываемых в разных экологических зонах, что привело к формированию определенных эколого-географических групп. В. Ф. Антропова описывает шесть таких групп в соответствии с биологическими, морфологическими и хозяйственными свойствами и местом происхождения сортов: северорусская, западноевропейская низинная, степная, западносибирская лесостепная, восточносибирская лесостепная, дальневосточная приморская.
Все районированные сорта зерновой диплоидной ржи представлены одной разновидностью — vulgare. Создание однолетней и многолетней тетраплоидной, многолетней диплоидной ржи привело к появлению новых разновидностей. В. Д. Кобылян- ский описал 39 разновидностей.