В соответствии с лицензией Министерства общего и профессионального образования РФ № 24Г-0200 от 1.04.1999 г. МГСУ ведет образовательную деятельность по 63 специальностям. Послевузовская подготовка, переподготовка и повышение квалификации осуществляются по 11 направлениям. Специалистами Университета разработаны и введены Государственные образовательные стандарты на вновь конституированные учебные дисциплины. Учебный план МГСУ включает в себя преподавание более 600 учебных дисциплин, факультативных и авторских курсов.
Основными структурными подразделения МГСУ являются:
Академия социальной работы (факультеты: социальной работы и администрирования; социальной педагогики; психологии; социальных технологий; повышения квалификации преподавателей вузов России; Федеральный центр социальной реабилитации детей, страдающих церебральным параличом);Академия социологии и управления (факультеты: социологии; социального управления; социальной информатики; социальной антропологии);Академия экономики и права (факультеты: юридический; социально-экономический; экономики и социологии труда; социального туризма);Академия охраны труда(факультеты социальной экологии и социального управления охраной труда); Академия информатики и информационных технологий(факультеты информационных систем и информационных технологий); Гуманитарная академия (факультеты: журналистики; политологии; иностранных языков; социальной экологии);
Территориальные образовательные учреждения-54 филиала и представительства на территории России, 10 Международных центров социального образования - в странах Балтии и СНГ.
Также в структуре Университета 80 кафедр; Институт социальных исследований; Научно-исследовательский институт социального образования; Институт социологии социальной сферы; Институт социального страхования; Институт социального управления; факультет социальной рекламы; фундаментальная научная библиотека; университетское издательство «Союз»; объединенная редакция научных журналов; система образовательных учреждений довузовской (лицеи, колледжи, гимназии, подготовительные курсы), дополнительной и курсовой подготовки.
В июне 1998 года МГСУ аттестован как классический университет в системе социального образования России.
Учредителями МГСУ являются Правительство России, а с октября 1998 года – и Правительство Москвы. Функции учредителя выполняет Министерство труда и социального развития Российской Федерации.