Обоняние, как признак, имеющий адаптивное значение, также находится под генетическим контролем. У мыши имеется около 1000 генов, ответственных за обоняние. Очевидно, что у человека подобных генов не меньше и располагаются они во многих хромосомах.
Среди неспособных различать запахи больше мужчин, чем женщин. Это объясняется тем, что ген, ответственный за этот признак, локализован в X-хромосоме. Y-хромосома этого локуса не содержит.
На грызунах показано, что гены рецепторов, ответственных за обнаружение феромонов (веществ, привлекающих особей противоположного пола), отличны от генов, ответственных за определение других запахов. У женщин обнаружено, что гены, ответственные за восприятие запаха мужского тела, формирующегося с участием антигенов HLA, передаются лишь по отцовской линии, а передача генов по материнской линии в восприятии данного запаха роли не играет.