Підземна ярусність фітоценозів вивчена гірше, ніж надземна. Розподіл коріння рослин по підземних ярусах визначається зміною з|із| глибиною ступеня|міри| зволоження грунту, його багатством поживними|живлячими| речовинами і зменшенням ступеня|міри| аерації грунту з|із| глибиною.
Підземні яруси виділяють на основі глибини проникнення коріння в грунт і розміщення активної, тобто здатної|здібною| поглинати воду і поживні|живлячі| речовини, частини|частці| кореневих систем, зазвичай,|звично| що має кореневі волоски. У лісах нерідко|незрідка| можна спостерігати три-шість підземних ярусів. Наприклад, в широколистяному ясенево-дубовому лісі виділяють ярус залягання кореневищ і коріння трав, що мілко|мілко| вкоріняються, ярус коріння трав, що більш глибоко укоріняються, один або два яруси коріння чагарників (більш поверхнево|поверхово| й більш глибоко укорінених), причому ці яруси можуть збігатися і тоді об'єднуються з|із| підземними ярусами трав, два яруси коріння дерев (верхній з|із| них утворюють коріння ясена, нижній більший| коріння дуба, що глибоко йде у грунт).
Підземні яруси, також як і надземні впливають один на одного. Коріння, що створює верхній підземний ярус, може перехоплювати дощову воду в|біля| рослин, коріння яких знаходиться|перебуває| у глибших ярусах. В свою чергу|своєю чергою| коріння, що складає| глибші підземні яруси, перехоплює капілярно воду, яка піднімається у|біля| коріння верхніх підземних ярусів.
Прийнято вважати|лічити|, що кореневі системи рослин, що входять в той або інший підземний ярус, використовують вологу й поживні речовини тих грунтових горизонтів, в яких розташований|схильний| цей ярус. Проте|однак| у фітоценозах з|із| недостатнім зволоженням в приповерхневих шарах утворюється тонке активне, так зване ефемерне|ефемер| коріння, що дуже швидко з'являється, але|появляється| так же швидко відмирає при пересиханні цих шарів.
У співтовариствах|спілках| з|із| переважанням посухостійких рослин часто|частенько| маса коріння у багато разів більше маси надземних частин|часток| рослин.
Нерідко кореневі системи змикаються в таких фітоценозах, де надземні частини рослин роз'єднані. Іноді, наприклад на щебнистих схилах, відбувається диференціація кореневих систем: утворюється коріння абсорбуюче і прикріплююче.