Ссылка с вашего сайта на ваш же собственный сайт, безусловно, не является независимым голосом "за" ваш сайт. Иначе говоря, поисковые движки предполагают, что вы будете голосовать за свой сайт.
Представьте себе, что ваш сайт имеет некий накопленный "сок ссылок" (благодаря всем ссылкам, полученным от сторонних web-сайтов), а ваша структура внутренних ссылок – это способ распределения полученного "сока" между страницами вашего сайта. Ваша внутренняя ссылочная структура исключительно важна, но она почти ничего не делает в плане накопления "сока ссылок" для вашего сайта.
Ссылки же с действительно независимого источника имеют гораздо больший вес. Немного поясним это. Предположим, что у вас есть несколько web-сайтов. Вполне вероятно, что они имеют общие данные в записях Whois (IP-адрес или контактная информация). Поисковые движки могут использовать эти сигналы, чтобы трактовать ссылки между такими сайтами, как внутренние (а не как честно заработанные внешние ссылки).
Даже если у вас есть разные записи Whois для web-сайтов, но они делают взаимные ссылки друг на друга, то поисковые движки легко могут это обнаружить. Помните, что web-сайт, который не имеет указывающих на него независимых ссылок, не имеет и достаточной ссылочной силы для того, чтобы голосовать за другие сайты.
Если поисковый движок видит кластер сайтов, которые делают множество взаимных ссылок, и многие из этих сайтов не имеют входящих ссылок (или имеют их мало), то ссылки с таких сайтов вполне могут быть проигнорированы.
Концептуально такой кластер сайтов следует считать единым сайтом. Взаимные ссылки между такими сайтами алгоритм будет считать единым сайтом, причем такие ссылки не будут ничего добавлять к количеству "сока ссылок" этих сайтов. Такой кластер будет оцениваться по входящим ссылкам на этот кластер.
Конечно, имеется множество различных способов реализации таких вещей, но создание большого количества сайтов (для установления взаимных ссылок между ними) в плане поисковой оптимизации совершенно ничего не дает.