Непрямий метод найменших квадратів (НМНК) використовують для знаходження оцінок точно ототожнених моделей. Процедуру знаходження структурних параметрів симультативної моделі НМНК можна умовно поділити на 3 етапи:
1. Для заданої структурної моделі будуємо скорочену форму у згорнутому та розгорнутому вираженні.
2. Оскільки екзогенні змінні у скороченій формі є не стохастичними, тобто не залежать від випадкової величини, то для знаходження оцінок коефіцієнтів скороченої форми застосовують метод найменших квадратів.
3. На основі системи параметричних взаємозв’язків та оцінених коефіцієнтів скороченої форми знаходимо оцінки структурних параметрів моделі. Оскільки рівняння точно ототожнене, то між структурними параметрами та параметрами скороченої форми є взаємооднозначна відповідність – ці оцінки будуть однозначними.
Оцінки параметрів симультативної моделі, знайдені НМНК, є оцінками з відхиленнями, які зникають із збільшенням вибірки, ці оцінки є консистентними.
Недоліком НМНК є те, що його застосовують тільки для точно ототожнених моделей.