Единственная форма, при которой нет видимого мягкотканного выпячивания. Может проявляться ликвореей или повторными менингитами. Может сочетаться с кранио-фациальными деформациями, напр., заячьей губой, оптико-нервной дисплазией, колобомой и микроофтальмией, гипоталамо-гипофизарной дисфункцией.
Иниэнцефалия характеризуется дефектом вокруг БЗО, рахишизисом и ретроколлисом. В большинстве случаев плод рождается мертвым, но некоторые дети выживают и доживают даже до 17 лет.