· Ризики непередбачених змін нецільових властивостей і ознак модифікованих сортів, пов'язані із плейотропною дією введеного гена. Наприклад, зниження стійкості до патогенів при зберіганні й стійкості до критичних температур при вегетації в сортів, стійких до комах- шкідників.
· Ризики відстроченої зміни властивостей, через кілька поколінь, пов'язані з адаптацією нового гена в геномі й c проявом як нових плейотропних властивостей, так і зміною вже декларованих.
· Неефективність трансгенної стійкості до шкідників через кілька років масового використання даного сорту.
· Можливість використання виробниками термінальних технологій для монополізації виробництва насінного матеріалу.
2.Ризики виробництва фармацевтичних препаратів у ГМО.
В 2003 р. виник термін "Фармагеддон". Підставою служить велика кількість сортів рису й кукурудзи, розроблених і культивованих різними компаніями, що несуть біологічно активні речовини, у тому числі: вакцини, гормони росту, фактори згортання крові, індустріальні ензими, людські антитіла, контрацептивні білки, що порушують імунітет цитокіни й викликають аборт препарати. Існують наступні ризики неконтрольованого використання такої продукції:
· загроза перезапилення й неконтрольованого поширення таких сортів серед харчових;
· ризик неконтрольованого експонування харчових вакцин вагітним;
· поширення вакцин і інших речовин, що виділяються в природних умовах з рослинних залишків через ґрунтові й поверхневі води.