Транзитная фумигация в судне - обеззараживание груза в трюмах судна без вывода его из эксплуатации, проходит в течение рейса и составляет от 5 суток и более в зависимости от глубины трюмов и метода обработки.
Фумигация судна в транзите должна проводиться только по усмотрению капитана судна. Многие факторы должны учитываться при выборе методов фумигации. Капитан должен знать требования правил государства судовладельца по вопросу фумигации транзите. Этот процесс должен быть согласован с администрацией порта погрузки.
Необходимо избегать контакта кожи с любым фумигантом.контакт кожи с парами может быть вреден. Необходимую защиту глаз человека можно обеспечить с помощью маски, полностью закрывающей лицо. Такая же маска требуется для защиты от вдыхания паров фумиганта. Все лица, имеющие дело с фумигантами, включая тех, которые выполняют погрузочно-разгрузочные работы с ними, должны быть ознакомлены с той опасностью, которую фумиганты представляют.
Для того чтобы обеспечить максимальную безопасность экипажа и судна во время проведения операций при мойке и дегазации грузовых танков, экипаж должен быть оповещен о начале и об окончании таких операций. Только персонал, имеющий достаточный опыт и непосредственно принимающий участие в процедурах по подготовке танков, может находиться в районе грузовой палубы. Как правило, мойка водой и дегазация грузовых танков не производится одновременно с погрузочно-разгрузочными операциями, однако такое требование не означает, что совмещение процедур запрещено.