1)префікс in- + b, p, m → im-: immaturus - незрілий (від in-maturus);
2)префікс in- + l, r → il- або ir-:
illustrare - висвітлювати, пояснювати (від in-lustrare);
3)префікс con- + b, p, m, l, r → com-: communis - звичайний (від con-munis);
4)звук b у префіксі sub- перед g, p, f уподібнюється до наступного звука:
suffrutex - напівкущ (від sub-frutex);
5)звук d у префіксі ad- перед c, g, p, f, l, r, s, t уподібнюється до наступного звука:
assistens - асистент (від ad-sistens);
6)звук s у префіксі dis- перед f переходить у f:
difficilis - важкий (від dis-facilis),
а перед d, g, l, m, r, s, v звук s взагалі випадає: di-varicatus - розлогий.
У біологічній номенклатурі вживаються також грецькі префікси, багато з яких є синонімічними або близькими за значенням до латинських префіксів.
| Латинські префікси | Грецькі префікси | Значення | Приклади |
| a-, ab-, abs- | apo- | віддалення, відхилення | aberratio – відхилення apocarpium - апокарпій |
| ad- | — | наближення | adaptatio - адаптація, пристосування |
| circum- | para-, | навколо, | circumstantia - навколишнє |
| peri-, amphi- | з обох сторін | середовище perianthum - оцвітина paraphyllum - прилист amphibia - земноводні | |
| con- | syn- | сполучення, | concultivar - сортотип |
| (com-) | (sym-) | сукупність | compactus - стислий synthesis - синтез symbiosis - симбіоз |
| de- (des-) | cata- | рух донизу | descendes - низхідний catacarolla - нижній вінчик |
| dis- (di-) | dia- | відокремлення | diffusus - розлогий dialysis - відокремлення речовин |
| e-, ex- | ec- | відсутність, рух із середини назовні | efoliatus - безлистий extractum - витяжка |
| extra- | ecto- | перебування поза чим-небудь | extrafloralis - позаквітковий ectospora - ектоспора |
| in- (im-) | a-, an- | 1) 1) рух у середину 2) заперечення, відсутність | impletus - наповнений inodoratus - непахучий aphyllus - безлистий |
| infra-, | hypo- | положення або | infrafoliaceus - підлистий |
| sub- | перебування під чим-небудь | subspecies - підвид hypogaeus - підземний | |
| inter- | meso- | положення між | intermedius - проміжний |
| dia- | чим-небудь або всередині чого- небудь | interspecificus - міжвидовий mesophyton - мезофіт diaspora - діаспора | |
| intra- | endo- | перебування всередині чого- небудь | intraspecificus - внутрішньовидовий endomyces - ендоміцес |
| per- trans- | dia- | рух через | perforatus - пробитий transformatio - перетворення diakinesis - діакінез |
| post- | meta- | положення після чого-небудь | рostremus - останній metatypus - метатип |
| prae- ante- | pro- | положення перед чим-небудь | praemontanus - передгірський antecendens - попередній prophyllum - передлист |
| re- | _ | рух назад, повторна дія | recurvatus - відігнутий назад repetitio - повторення |
| se- | відділення | selectio - відбір, селекція separatio - відділення | |
| super- supra- | hyper- epi- | положення або перебування над чим-небудь | superspecies – надвид suprafoliaceus - надлистий hypertrophia - гіпертрофія epigaeus - наземний |