Большие пятна на фотографии удобно убирать инструментом Marquee (Область). Для этого выберите один инструментов - Elliptical Selection (Овальная область) или Rectangular Selection (Прямоугольная область), входящих в группу инструментов Marquee (Область), и выделите с их помощью фрагмент хорошо изображенного фона (без пятен). Затем, используя команду Edit (Редактирование) | Copy (Копировать) скопируйте его в буфер обмена (clipboard). Выберите команду Edit (Редактирование) | Paste (Вставить) для создания дубля области хорошего фона и, используя инструмент Move (Перемещение), перетащите его на место пятна. В результате пятно маскируется областью хорошего фона, поскольку пока область "правильного" фона как бы висит над дефектом в отдельном слое, расположенном поверх фонового слоя. После завершения операции устранения крупных пятен на фотографии выполните команду Layer (Слой) | Flatten Image (Выполнить сведение) или нажмите соответствующую ей комбинацию клавиш Ctrl+E. Последняя команда совмещает (интегрирует) все созданные в процессе работы слои с фоновым слоем.
Для ретуши мелких пятен следует воспользоваться инструментом Smudge (Палец) с целью удаления мелких дефектов путем их размазывания. Выберите на панели графики инструменте Smudge (Палец) и выполните настройку его атрибутов с помощью панели свойств: задайте режим (Mode) - Normal (Нормальный), снимите флажок Finger Painting (Рисование пальцем), установите значение параметра Pressure (Интенсивность) равным 50% и выберите из списка Brush (Кисть) кисть, соизмеримую с размером пятен. Выполните инструментом Smudge удаление пятен на снимке путем их растушевки (размазывания). Мелкие пятна можно удалять также инструментом Blur (Размытие).