родился в 1897 году в Лифляндской губернии в семье батра ка. В марте 1917 года мобилизован в армию. По окончании Одесской военной школы прапорщиков направлен на Западный фронт. Вел большевистскую пропаганду среди сол дат, участвовал в создании солдатских комитетов.
После революции работал в партийных и советских органах, был комиссаром Донской области. В мае 1919 года был назначен военным комиссаром Орловской губернии, затем комиссаром 55–й стрелковой дивизии. Участвовал в боях с деникинцами.
В 1924 году окончил Военную академию РККА. В августе 1926 года назначен заместителем начальника управления ВВС РККА. В ноябре 1929 года окончил Качинскую авиационную школу, получил звание военного летчика. В июне 1931 года, после командировки в Германию, стал начальником ВВС РККА и членом Реввоенсовета.
С именем Алксниса связаны многие важные мероприятия по совершенствованию организационной структуры ВВС, оснащению их новой боевой техникой. По его инициативе были установлены обязательная периодическая проверка техники пилотирования у летного состава, предполетная подготовка экипажей, внедрялись полеты по приборам вне видимости земли.