Развитие кришнаизма породило много внутренних проблем, что было естественным процессом. В первую очередь это было связано с тем, что большинство людей были нерелигиозными до обращения в секту. Только треть из общего числа неофитов происходили из протестантских семей. ОСК в это время ощущало острую нехватку руководителей, консультантов и их советников. Это привело к тому, что уже в середине 60-х гг. среди них стали процветать явления, неизбежные там, где существует стремление к святости при отсутствии опытных наставников. Среди кришнаитов стало процветать лицемерие, обман, нетерпимость, стремление к совершению каких-то больших дела и пренебрежение малыми делами. В результате в секте возникла большая текучесть кадров. Её причинами было нарушение 4-х т.н. регулирующих принципов, в результате чего у многих возникла депрессия из-за того, что они не могли в своей жизни осуществить эти 4, на первый взгляд несложные, предписания. Обычно уход проходил тихо, и покинувший секту считался предателем. Наибольший размах отпадения от МОСК наблюдался после смерти Пракхупады в 1977 г. В секте осталось несколько старших гуру и движение кришнаитов оказалось перед угрозой распада и полного краха. Началась череда отпадений, которая затронула 90% всех, кто был инициированным монахом, полным кришнаитом. Массовый отход произошел ещё при жизни Пракхупады, но он в той ситуации понял, что необходимо изменить некоторые первоначальные установки. Вме6сто призвания к монашеству он взял курс на агитацию призвания к заключению браков между членами общины. Однако здесь гуру ожидало разочарование. Браки стали заключаться без предварительного знакомства молодоженов, и такие семьи вскоре стали распадаться. Тогда Пракхупада в 1974 г. отказался от этой практики. Семейная жизнь снова стала подвергаться резкому переосмыслению. Её стали сравнивать с глубоким темным колодцем. Опять стал распространяться призыв к уходу в монашество, в результате чего резко увеличилось число монахов, и между монахами и домохозяевами началась война, в особенности против женщин. В таком состоянии внутреннего разбора в секте в возрасте 82 лет скончался Пракхупада.
Руководство обществом было передано в руки его учеников, кришнаитский опыт которых в лучшем случае насчитывал 12 лет. Новые руководители игнорировали печальный опыт своих предшественников, и по прошествии 10 лет с момента создания общества 6 из 11 опытных гуру были лишены своих полномочий и дальнейшее существование ОСК вновь оказалось перед возможностью краха. Этот процесс продолжается и сейчас. Несколько лет назад отпал один из авторитетнейших гуру, вступивший в брак со своей помощницей, медсестрой из Швеции, тем самым наруш9ив один из основополагающих принципов кришнаизма.