Конформационно-зависимый дизайн последовательностей цепи

Конформационно-зависимый дизайн последовательностей цепи. В этой главе рассмотрим НР - сополимеры, то есть полимеры состоящие из двух типов звеньев, и компьютерную реализацию дизайна различных моделей. 2.5.1. НР сополимеры, приспособленные к адсорбции Такие сополимеры получают по следующей схеме.

Гомополимерную цепь, состоящую из звеньев Н, адсорбируем на плоской поверхности. Для этого вводится сильное притяжение между звеньями цепи и поверхностью. Затем звенья, лежащие ближе к поверхности, обозначаем как Н, другие звенья как Р. В компьютерном эксперименте это значит, что eН eР. Таким образом, звенья Н считаются лиофобными, то есть избегают взаимодействия с растворителем, а звенья Р лиофильными. 19 На рис. 2.4 проиллюстрирована схема получения таких сополимеров.

Рис. 2.4. Получение первичной структуры НР -сополимера, приспособленного к адсорбции . 19 Если говорить о реальном эксперименте, то модифицирование звеньев цепи происходит на каталитической поверхности. Таким образом, можно видеть основную идею молекулярного дизайна. Сначала мы получаем пространственную структуру адсорбированного сополимера, а затем исследуем свойства полученной цепи. Поведение такой структуры сравнивали со случайными и случайно-блочными последовательностями.

Оказалось, что число адсорбированных звеньев у таких сополимеров гораздо выше. То есть такие последовательности сохраняют память о своей адсорбированности. Таким образом, процесс адсорбции протекает более полно. 2.5.2.