Эукариотические ДНК-полимеразы a (Pola) входят в состав состоящего из 4 субъединиц белкового комплекса, в котором две самые большие субъединицы определяют ДНК-полимеразную активность, а две малые субъединицы – праймазную активность, т.е. способность синтезировать затравки РНК на матрице ДНК (см. 2.3). Поэтому главная функция комплекса ДНК-полимераза a - праймаза состоит в синтезе фрагментов Оказаки при репликации отстающей нити, а также при инициации репликации ведущей нити.
Главная ДНК-полимеразная субъединица (субъединица А) этого комплекса имеет мол. массу 165 кД (р165) у дрожжей S. cerevisiae и 180 кД (р180) у человека. Ее центральный полимеразный домен (положения ~ 650-1110 у дрожжей) содержит типичные для ДНК-полимераз этого семейства элементы DxxSLYP (мотив А) и YGDTDS (мотив С), включающие триаду каталитических кислых остатков асп. Эти мотивы находятся в субдомене ладони в 3-мерной структуре Pola. Ближе к N-концу расположен домен, очень похожий на (3’®5’)-экзонуклеазные мотивы ДНК-полимераз семейства В (остатки ~330-650). Однако у ДНК-полимеразы a заменены существенные для катализа остатки в 3 консервативных экзонуклеазных мотивах, и она не проявляет корректорскую (3’®5’)-экзонуклеазную активность in vitro и с высокой частотой (в среднем 10-4) включает в ДНК ошибочные основания. Поэтому Pola не может являться главной репликативной ДНК-полимеразой.