Для окрашивания микробов используют анилиновые красители (основные, кислые и нейтральные). Микроорганизмы лучше окрашиваются основными красками. Для окраски препаратов готовят спиртовые, водно-спиртовые и водные растворы. В некоторых случаях добавляют в качестве протравы карболовую кислоту, щелочь и др. Наиболее часто употребляемыми красителями являются следующие:
синие - метиловый синий, водный синий, опаловый синий;
красные - фуксин основной, конго красный, сафранин, нейтральный красный, фуксин кислый;
фиолетовые - метиловый фиолетовый, кристаллический фиолетовый, генцианвиолет;
зеленые - малахитовый зеленый, бриллиантовый зеленый, светло-зеленый;
желто-коричневые - хризоилин, везувин.