Нарушение эрекцииможет возникнуть в результате многих заболеваний. Диабет (нарушение регуляции содержания сахара в крови) и алкоголизм - две самые главные причины импотенции. Только в США эти два фактора, вероятно, повинны в нескольких миллионах случаев данного расстройства. К другим органическим причинам нарушения эрекции относятся: травмы спинного мозга, рассеянный склероз и другие неврологические заболевания; инфекции или травмы полового члена, яичек, мочеиспускательного канала или предстательной железы; гормональная недостаточность; нарушение кровообращения. Иногда затруднения эрекции возникают в результате приема лекарственных препаратов (например, назначаемых при гипертонии), возбуждающих препаратов (амфетамины), психотропных средств (барбитураты) и наркотиков.
Преждевременная эякуляция редко бывает вызвана органическими факторами. Из более чем 500 больных с жалобами на преждевременную эякуляцию, прошедших через Институт Мастерса и Джонсон, лишь у одного данное расстройство было обусловлено болезнью.
При несостоятельности эякуляции иногда обнаруживаются неврологические расстройства (примерно в одном случае из 20). Наркомания и алкоголизм служат причиной нарушения эякуляции примерно в 10% случаев. Некоторые лекарственные препараты, например ганетдин (торговое название исмелин) и ингибиторы моноаминоксидазы (используемые для лечения депрессии), также могут влиять на процесс эякуляции.
Болезненность полового сношения у мужчин может быть связана с несколькими различными органическими проблемами, хотя по крайней мере половина таких случаев вызывается психосоциальными факторами. Воспаление или инфекция полового члена, крайней плоти, мочеиспускательного канала или предстательной железы - наиболее вероятные органические причины диспареунии у мужчин. Небольшое число мужчин испытывают боль, если кончик полового члена поцарапан или раздражается нитевидной нижней частью ВМС, выступающей из шейки во влагалище. У некоторых других мужчин болезненное раздражение полового члена возникает при соприкосновении с противозачаточными пенами или мазями, вводимыми во влагалище.