ДНК-гликозилазы и эндонуклеазы клеток микроорганизмов и человека, участвующие в BER

Фермент	Источник	Ген	Субстрат (см. рис. I.57)
Урацил-ДНК-гликозилаза	E. coli S. cerevisiae Человек	ung UNG UDG	а » »
3-Метиладенин-ДНК-гликозилаза	E. coli » S. cerevisiae Человек	tag alkA MAG MPG	к з, к–м, (б, и) б, к, л к, (д)
Fapy/8-оксогуанин-ДНК-гликозилаза (fapy – формамидопиримидин)	E. coli S. cerevisiae Человек	fpg/mutM ? ?	в–д г и/или д »
Эндонуклеаза III/тимингликоль-ДНК-гликозилаза	E. coli	nth	в, е, ж
Эндонуклеаза VIII	E. coli	nei	»
A-G-ДНК-гликозилаза	» Человек	mutY ?	Аденин/в »
G-T-ДНК-гликозилаза	»	?	G-T, (U-G)
УФ-эндонуклеаза	T4   M. luteus	?   ?	Пиримидиновые димеры То же
Гидроксиметилурацил-ДНК-гликозилаза	Человек	?	з
Формилурацил-ДНК-гликозилаза	»	?	Ж
Примечание. В скобках приведены предположительные субстраты.

Рис. I.57. Модифицированные азотистые основания ДНК, удаляемые ДНК–гликозилазами при функционировании BER

а – урацил; б – гипоксантин; в – 5–гидроксицитозин; г – 2,5-диамино-4-формамидопиримидин; д – 7,8-дигидро-8-оксогуанин; е – мочевина; ж – тимингликоль; з – 5-формилурацил; и – 5-гидроксиметилурацил; к – 3-метиладенин; л – 7-метилгуанин; м – 2-метилцитозин

 

АР-дезоксирибоза (apurinic/apyrimidinic deoxyribose), образовавшаяся в результате удаления модифицированного азотистого основания апуринового/апиримидинового (AP-) сайта, далее вырезается с помощью АР-лиазы, которая освобождает ее 3’-конец, и АР-эндонуклеазы, гидролизующей ее 5’-концевую фосфодиэфирную связь в АР-сайте (см. рис. I.58). Однонуклеотидная брешь затем заполняется с помощью ДНК-полимеразы, и фосфодиэфирная связь восстанавливается в реакции лигирования. У E. coli репаративный синтез ДНК выполняет ДНК-полимераза I, у дрожжей – ДНК-полимераза d. Из трех ДНК-лигаз, которыми обладают клетки животных, в BER, по-видимому, участвует ДНК-лигаза III.