Механизм инициации синтеза (+) цепей.

Может быть для синтеза достаточно VPg-pUpU.

Чтобы на (-) цепи осуществить синтез (+) цепи нужно вытеснить предыдущую цепь. Для этого требуется хеликазная активность. У белка 2С пикорнавирусов имеется участок подобный РНК-зависимой АТФазе и показано, что он участвует в синтезе РНК (в миллимолярных концентрациях). Однако, напрямую не показано, что 2С нужен как хеликаза. У полиовируса РНК-полимераза может сама вытеснять цепь, но хеликаза ей может помочь.

Для синтеза (-) цепи (??????) нужна трансляция. При трансляции происходят структурные изменения (какой цепи?), приводящие к обнажению 3’-конца (какой цепи?).

Транскрипция и трансляция не могут одновременно происходить на одной цепи, они должны быть разнесены во времени.

Переключателем между этими процессами может служить клеверная структура 5’-НТО. Другим переключателем может быть PCBP, который может связываться и с IRES, блокируя инициацию трансляции, следовательно, чем больше РСВР, тем слабее трансляция.

Для образования вирусных частиц нужно 60 молекул структурного белка. Поскольку при трансляции образуется полипротеин, то, в таком случае, образуется столько же копий и неструктурных белков, но их нужно мало. В случае РНК-полимеразы известно, что транскрипцию осуществляет только свежий «фермент».