Транспортный путь Беломорско-Балтийского канала имеет протяжённость в 227 км с подходными каналами от Онежского озера доБелого моря, из них 37,1 км составляют искусственные пути[5][30][31] (по другим источникам 43 км[32][33] или 48 км[34]).
Условным направлением течения считается направление от Онежского озера к Белому морю, все навигационные знаки (буи,маяки) оборудованы в соответствии с этим правилом.
Канал начинается у посёлка Повенец в Повенецкой губе Онежского озера. Сразу за Повенцом следуют семь шлюзов, расположенных на небольшом расстоянии друг от друга (так называемая «Повенчанская лестница»). Вместе эти шлюзы образуют Южный склон канала. Между седьмым и восьмым шлюзами находится водораздел канала.
На трассе северного склона расположено двенадцать шлюзов (№ 8 — 19). Трасса Северного склона канала проходит через пять крупных озёр: Маткоозеро (между шлюзами 8 и 9), Выгозеро (между шлюзами 9 и 10), Воицкое озеро (между шлюзами 10 и 11),Палагорка (между шлюзами 11 и 12) и Маткожня (между шлюзами 13 и 14).
На севере канал впадает в Сорокскую губу Белого моря, в устье канала расположен город Беломорск.
На берегах канала расположены следующие крупные населённые пункты: Повенец, Сегежа, Надвоицы, Сосновец, Беломорск.