Принципы организации и деятельности арбитражных судов весьма близки к тем принципам, на которых строится система судов общей юрисдикции. При осуществлений своих полномочий суды арбитражных судов обладают статусом установленным законом о статусе судей.
Закон об Арбитражных судах констатирует «Деятельность арбитражных судов в РФ строится на основе принципов законности, независимости судей, равенства организаций и граждан перед законом и судом, состязательности и равенства сторон, гласности и разбирательства дел. Арбитражно-процессуальный кодекс РФ называет ещё и принцип непосредственности (ст. 10) непрерывности (ст. 117) национального языка судопроизводства (ст. 8), которые, как известно, действуют при осуществлении правосудия в судах общей юрисдикции.
Одной из самых существенных новелл является введение принципа осуществления правосудия арбитражным судом (ст. 1 АПК) причем действие этого принципа в условиях арбитражного судопроизводства имеет свои особенности. Имеется ввиду только суды, указанные в специально им посвященном законе и только судьи этих судов, назначаемые в порядке предусмотренном ст. 125 Конституции РФ и законом об Арбитражных судах.
Судопроизводство во всех арбитражных судах ведется только на русском языке, тому кто не владеет, предоставляется переводчик.
Усилена роль принципа диспозитивности. В АПК нет прежних правил о возможности арбитражного суда изменять по своей инициативе предмет и основание иска, выходить за пределы исковых требований, уменьшать размер неустойки (штрафа, пени) подлежащего взысканию одного из сторон, отсрочить или рассрочить исполнение решения.
Изменения внесены в принцип коллегиальности. В арбитражных судах первой инстанции все дела рассматриваются единолично, за исключением дел о признании недействительности актов государственных органов, органов местного самоуправления и дел о банкротстве. По решению председателя Арбитражного суда любое дело может быть рассмотрено коллегиально.
Более демократично, чем прежде, решен вопрос о гласности производства в Арбитражном суде. В заседании арбитражных судов всех инстанций лица, присутствующие в зале, могут делать заметки, вести стенограмму и звукозапись.
Кино и фотосъёмка, трансляции – возможны с разрешения суда рассматривающего дело.