Международно-правовое сотрудничество государств в защите флоры и фауны связано в первую очередь с исчезающими и редкими видами, с мигрирующими видами животных, с охраной природы в конкретных регионах. Это — наиболее быстро развивающаяся сфера природоохраны.
Выделяется ряд конкретных направлений сотрудничества в данной сфере, каждое из которых включает группу договоров:
регулирование рыболовства и промысла морских ресурсов (Международная конвенция по регулированию китобойного промысла 1946 г., Конвенция о рыболовстве в водах Дуная 1958 г., Конвенция о рыболовстве и сохранении живых ресурсов в Балтийском море и проливах 1973 г., Конвенция об охране живых ресурсов юго-восточной части Атлантического океана 1969 г., Конвенция о сохранении морских живых ресурсов Антарктики 1980 г., Конвенция о сохранении ресурсов минтая и управлении ими в центральной, части Берингова моря (Вашингтон, 1994 г.) и др.); охрана растительного мира (Международная конвенция об Охране растений 1951 г., Соглашение о сотрудничестве в применении карантина растений и их охране от вредителей и болезней 1959 г., Международное соглашение по тропической древесине 1983 г., Международная конвенция по охране новых растений 1961 г., пересмотрена в 1991 г., и др.); защита конкретных видов (Международная конвенция о сохранении атлантического тунца 1980 г, Конвенция, об охране атлантических тюленей 1972 г., Соглашение о сохранении белых медведей 1973 г., Соглашение об охране малых китов Балтийского и Северного морей 1992 г., Протокол между Правительством РФ и Правительством КНР об охране тигра 1997 г. и др.); охрана мест обитания (Конвенция о водно-болотных угодьях, имеющих международное значение главным образом в качестве местообитаний водоплавающих птиц, 1971 г., двусторонние конвенции об охране перелетных птиц и среды их обитания, Соглашение между Правительством РФ и Правительством КНР о заповеднике "Озеро Ханка" 1996 г.); защита редких и мигрирующих видов (Конвенция о международной торговле видами дикой фауны и флоры, находящимися под угрозой исчезновения, 1973 г., Конвенция об охране мигрирующих видов диких животных 1979 г.).