Поправку Касамби использовали для маркера T20D163, т.к рассчитанное расстояние больше 10сМ

Задание 7. Используя суммарную информацию по сцеплению с разными маркерами, постройте генетическую и физическую карту для района локализации Вашего гена.

Почему Вы решили, что исследуемый ген лежит именно в этой стороне от самого тесно сцепленного с ним маркера? Как это проверить? – опишите.

При наличии достаточного количества рекомбинантов в выборке, их анализ дает возможность расположить ген относительно маркеров, исходя из встречаемости рекомбинантов по близко-лежащему маркеру и следующего за ним. Исследуя отдельные растения, смотреть, по каким маркерам оно рекомбинантно, из чего делать вывод, где расположен наш ген.

На генетической карте были расположены маркеры, а затем от них отложены рассчитанные расстояния до гена ТАЕ, после чего оказалось, что три маркера указывают именно на это положение относительно PID.

Почему иногда наблюдается противоречие между физической и генетической картой, например AG и CH42?

Из-за неравномерности прохождения кроссинговера на хромосоме, что вызвано различной структурой хроматина вдоль хромосомы.

Задание 8. Если Вы уже определили, среди каких ОРС искать Ваш ген, то попробуйте найти гены – кандидаты, с которыми следует начать работу в первую очередь.

(1) Проанализируйте каждый ген (ОРС) – может быть по этому гену уже есть мутанты (в том числе, Т-ДНК и транспозонные) и они исследованы раньше? Каков их фенотип?

(2) На основании изучения фенотипа Вашего мутанта Вы уже знаете, где (в каких органах) и когда (на какой стадии онтогенеза), при каких условиях (например, ген контролирует устойчивость к холоду – значит точно должен реагировать на него иначе, чем дикий тип) экспрессируется. Ген-кандидат демонстрирует эти особенности (базы данных микроэррей) ?

AT2G34780

AT2G38170

AT2G38170