РНК-содержащих вирусов: пикорнавирусы и альфавирусы

Лекция 11

Сегодня мы рассмотрим две группы РНК-содержащих вирусов: пикорнавирусы и альфавирусы.   Пикорнавирусы.

Структура генома.

      К 5’-концу ковалентно (через тирозин – урацил) пришит белок, а на 3’-конце имеется полиА последовательность,…

Механизм инициации синтеза (+) цепей.

Может быть для синтеза достаточно VPg-pUpU. Чтобы на (-) цепи осуществить синтез (+) цепи нужно вытеснить предыдущую цепь.… Для синтеза (-) цепи (??????) нужна трансляция. При трансляции происходят структурные изменения (какой цепи?),…

Генерация разнообразия вирусных геномов.

У полимеразы (как впрочем и у ДНК-зависимой РНК-полимеразы) отсутствует корректирующая активность. Это обусловливает частоту ошибок 10-4, т.е. одна…   Рекомбинация.

Суперсемейство пикорнавирусов.

 

Вирусы животных и растений. Принципиальных отличий в структуре РНК и механизмах репликации по сравнению с пикорнавирусами нет. Одноцепочечная (+) РНК на 5’-конце ковалентно связана с VPg, который помимо затравочной может выполнять и другие функции, на 3’-конце находится polyA. Геном одно- или двухсегментный, кодирует РНК-полимеразу. Для синтеза (-) цепи нужен 5’-конец. Работа in trans (??????).

 

 

Альфавирусы.

Размер Ø 70 нм, капсид икосаэдрический, имеется липопротеидная оболочка. Геном представлен одноцепочечной (+) РНК длиной 11-12 т.п.н. РНК…                         …

Функции неструктурных белков.

NS 1. Состоит из двух доменов: N-концевой обладает метил-трансферазной активностью, а С-концевой – гуанилтрансферазной. Это кэпирующий фермент.…   NS2 (P2). Обладает тремя активностями: хеликазной, протеазной и γ-фосфатазной. Участвует в кэпировании РНК,…

Связь протеолиза с временной регуляцией синтеза РНК.

На примере α-вирусов хороша заметна роль протеолиза в регуляции репликации вируса. От степени процессированности полипротеина неструктурных… 123 4 преимущественно синтезируются (-) РНК. 1 23 4 преимущественно синтезируются (+) геномные РНК и какая-то часть (-) РНК

Роль клеточных белков в репликации вирусной РНК.

Могут принимать участие система декэпирования, а также десатураза жирных кислот.

Рекомбинация РНК.

Внутри промоторов для полимеразы локализуются горячие точки рекомбинации.

 

РНК-интерференция в клетках, пораженных ВТМ.

30 лет назад было обнаружено, что в клетках, инфицированных ВТМ увеличивается количество активной РНК-зависимой-РНК-полимеразы. Тогда предположили, что индуцируется синтез клеточного фермента, но не могли понять почему в клетках специфически синтезируются короткие фрагменты РНК. Явлению не нашли разумного объяснения и забыли, а это была система РНК-интерференции.