Ферменты фолдинга

В клетке ПДИ связана в основном с эндоплазматической сетью. Поэтому особенно велика ее роль в формировании тех белков, которые синтезируются мембраносвязанными рибосомами. Это экспортные, мембранные и лизосомные белки.

1.3.1.2. Пептидилпролилизомераза(ППЛ).Известно, что пролин и продукт его гидроксилирования – гидроксипролин не является аминокислотой т.к. его радикал связан не только с углеродным атомом, но и с азотным. Поэтому образуется не амино-, а иминокислота (рис.1.7). Это сказывается на пространственной конфигурации пептидной цепи в месте содержания пролина. Здесь не образуется ни a-спирали , ни b-структуры, и пептидная цепь часто делает изгиб в ту или иную сторону. Причем возможность изгиба определяется тем, как расположены радикал соседней аминокислоты и радикал пролина относительно плоскости соответствующей пептидной связи (вращения вокруг которой невозможны). Радикалы находятся в транс-конфигурации, если расположены по разные стороны плоскости, и в цис–конфигурации, если находятся с одной стороны.

В отсутствии резкого изгиба пептидной цепи предпочтительней транс-конфигурация, т.к. при ней соседние радикалы не «мешают» друг другу.

В случае изгиба по принципу «поворот на себя» (т.е. почти на 180⁰) часто более оптимальной является цис-конфигурация, когда оба соседних радикала оказываются с наружной стороны изгиба.

ППИ катализирует переход радикалов в области пептидной связи пролина из транс-конфигурации в цис-конфигурацию и обратно. При этом происходит временный разрыв данной пептидной связи, разрешая поворот вокруг ее плоскости, после поворота связь снова замыкается. Таким образом, ППИ позволяет пептидной цепи в области пролина делать такие изгибы, которые приводят к оптимальной пространственной структуре.

Рис 1.7. Реакция пептидил-

пролилизомеразы